2017-2021年，中心在全国举办100多期全国河长制培训研讨班。培训研讨班期间，中国水利工程协会会长、水利部建设与管理司原司长孙继昌，瑞典皇家科学院外籍院士、水利部水资源司原司长吴季松，国际宇航科学院院士王晋年，水利部信息中心主任蔡阳，水利部发展研究中心副主任王冠军、李肇杰，河海大学校长徐辉，国务院发展研究中心资源与环境政策研究所研究员王亦楠，水利部发展研究中心河长制工作处处长刘小勇，江苏省水利厅副厅长、江苏省河长办常务副主任张劲松，江苏省河道管理局局长刘劲松，水利部大坝安全管理中心主任、南京水利科学研究院副院长孙金华，清华大学教授王亚华，长江水利委员会长江科学院副院长陈进，河海大学河长制研究与培训中心常务副主任、水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心副主任鞠茂森，中共中央党校（国家行政学院)教授、中国公共服务研究院院长程萍，水利部科技推广中心教高肖新民，中国水利学会教高李贵宝，河海大学教授崔广柏、杨春福、李轶、谢悦波、姜翠玲、唐德善、方国华、李一平、丰景春，以及南京水利局原巡视员王凯、绍兴市治水办（河长办)专职副主任孙炎松、德清县专家河长齐连惠博士等专家学者先后多次为培训研讨班授课，系统介绍了水资源管理与保护、河湖水域岸线管理保护、水污染防治、水环境治理、水生态修复、执法监管等方面内容，受到学员广泛好评。